necesitas calcular la calificacion por cada actividad .
en tu curso calificaciones->categorias items->vista simple
y le das en editar calculo total del curso es una imagen de una calculadora.
por ejemplo
Evaluación Inicial*10+Evaluación 1*20+Evaluación 2*40 +Evaluación Final*40
y esto nos dara un resultado del 100%
te paso la siguiente liga donde te explica que tienes que asignar su id a cada actividad y las funciones de calculo.
http://docs.moodle.org/all/es/C%C3%A1lculos_de_calificaci%C3%B3n