Stalo se mi totéž.
Vrátil jsem systém ze zálohy do původního stavu 1.9.7 a šel upgrade znovu přes 1.9.19. Doposud OK.
Pak následoval upgrade na 2.0.10 (vymazání celého adresáře mimo config.php) a při procesu upgrade je tam někde volba "legacy files", kterou je potřeba povolit. Následně se systém ještě jednou zeptal s varováním, že to není dobrý nápad atd. Ale když se to odklikne, zůstala PDFka v kurzech i do verze 2.2.11