Hola Jairo,
Mira een el diretorio moodledata es dónde moodle guarda todos los archivos que se van subiendo a los cursos. Su estructura, generalmente, es la siguiente.
moodledata
|->Uploads (dentro de uploads tendras carpetas numeradas, cada una de
| ellas corresponde a un curso que tengas en la Plataforma)
|->1 (Estas carpetas corresponden a los cursos y dentro
|->2 de cada una de ellas tendrás los archivos que
|->3 hayan subido en cada cuso, recursos, webs,etc.)
| (El contenido de estas carpetas puedes borralo para
| descargar un poco el servidor, así quitarás los recursos que
| se hayan subido de los cursos. Es acomo ir a la parte de
| Archivos, en el menú de Administración de un curso y
| eliminar todos los archivos que aparecn allí. No olvides
| quitar las referencias que aparecen en los cursos)
|->Users (Aquí se guarda la información de los usuarios,
bueno, en realidad, las fotos de cada usuario, la
información se guarda en la Base de Datos). De la
misma manera que antes cada carpeta corresponde a un
usuario. En esta carpeta ocupara espacio dependiendo el
número de usuarios (aunque debido al tamaño de las
fotos no suele ocupar mucho)
Básicamente estos son los directorios principales que deberías mirar, aunque también deberias comprobar dónde se hacen las copias de seguridad de los cursos, porque si las tienes programadas para que se ralicen por defecto, seguramente tendrás dentro de cada carpeta correspondiente a cada curso, o sea, en Uploads->X (siendo x el nº del curso) otra carpeta llamada backupdata en donde estará la copia de seguridad del curso y esa carpeta sí que puede ocupar bastante.
Tabién hay otros directorios como "cache", "sessions" (aquí se guarda información de las sessiones), "mysql", "temp", pero suelen estar vaciós u ocupar muy poco espacio.
De todas formas y como te he comentado antes brevemente, para eliminar archivos que se han subido en los cursos y que ya no vas a necesitar. la menara más cómoda dehacerlo es la siguiente:
Entras en el curso y en la parte izaquierda, en el menú Administración->Archivos te aparaecerá un listado con todos los archivos de ese curso, seleccione los que no necesites y elige de la lista depleagble que aparece abajo la opción "Borrar". Así te evitarás eliminar algun archivo por error y cosas de esas. De todas formas, no creo que venga nada mal saber un poco sobre la estructura de directorios de Moolde.
En fin, ya te he soltado bastante rollo.
Espero haberte ayudado.
Salu2.
Raul.