Hola Mauricio
no se si planteas una migración, desde la 1.9 a la 2.5 tienes que hacer migraciones intermedias de versiones, hay mucha info en la red.
Quizas lo más pragmatico sería instalar una 2.5 y en ella, subes los 4000 usuarios.
Exporta, accciones de usuario masivas tus users desde la 1.9 y luego via csv los subes a la 2.5
Espero que te sea útil
Saludos
Paco Franco