Hola Carlos,
creo que la opción Grupo permite dividir los diferentes grupos en recursos que generan actividad, foro, chats, tareas, etc.
La iniciativa de plantear grupos con todos los recursos totalmente independientes, puede asemejarsse más al concepto cursos diferentes, por ello, tal vez la solución más práctica pueda ser crear otro curso, con otros alumnos, donde si se suban documentos específicos, para esos determinados alumnos.
Espero que pueda serte útil
Saludos!