La seguridad de moodle depende del administrador. De por si, moodle es bastante seguro pero en la actualidad hay que pensar mas alla de moodle.
Si te refieres a los contenidos, entonces no hay protección. Un video, un PDF o cualquier otro contenido puede descargarse si el usuario tiene conocimientos suficientes para hacerlo.
Las compañias no te las voy a decir pero nuestros clientes son desde grandes multinacionales hasta pequeñas academias que imparten cursos muy especificos. Hasta ahora hemos implementado moodle sin problemas incluso en casos muy complejos por los requisitos que solicitaban los clientes.