Hola Alberto,
Salvo lo que pueda aclarar Fernando, mi opinión es que no estás usando adecuadamente los conceptos de Scorm.
Lo que tu llamas "Navegación de Moodle" (pantalla 1) no es tal.
Lo que ves es una especie de menú que viene definido en el propio Scorm a través del manifiesto (Ej. imsmanifest.xml).
Este componente de los SCO tiene como una de sus funciones comunicarle el orden o secuencia de los elementos del aprendizaje a las plataformas tipo LMS/CMS (Ej. Moodle).
Entonces cuando quieres que el estudiante siga tal "ruta de aprendizaje", lo que debes hacer es definirla a través del manifiesto.
De esta manera, las plataformas entienden que antes o después de tal o cual recurso sigue tal o cual otro y entonces registran si algo ya fue revisado o no.
Entonces, en tu SCO lo que debes hacer es poner como pantalla inicial una bienvenida o unas instrucciones o lo que sea, de manera que el alumno avance, ya sea con un botón incluido en esta primer pantalla, o bien, a través de dar clic en el menú que construye la plataforma a partir del manifiesto.
Para definir la secuenciación, usa el programa Reload Editor.
Aquí un tutorial en el que te explican cómo hacerlo.
A nivel más técnico, tienes que revisar más o menos qué es el Modelo de Agregación de Contenido (Content Aggregation Model, CAM).
Ello, pues el manifiesto es un concepto atado al CAM.
Para ello, te sugiero revisar esto.
Como conclusión, dado que no estás usando/implementando adecuadamente los conceptos de Scorm, no vas a lograr lo que deseas.
Ya Fernando lo explicó: un SCO no puede contener otro SCO , ni referir otro SCO dentro del mismo paquete.
Tienes que crear diferentes SCO y luego agregarlos vía el manifiesto.
Saludos