В каждом курсе есть свой журнал оценок. Чтобы собрать в одном журнале итоговые оценки по всем изучаемым академической группой дисциплинам, нужен модуль Субкурс. Для Moodle 2 он пока не работает. Может заработает как раз, когда откроется ваш долгий ящик.