Ciao Francesco,
come workaround potresti provare a scaricare i file, ove possibile, in formato csv. Tuttavia, se riesci ad aprire i file xls con Libre Office, potrebbe trattarsi di un problema legato alla compatibilità dei formati lato client. La discussione è duplicata nei forum in inglese: https://moodle.org/mod/forum/discuss.php?d=225045.