Buenos días, Alejandro.
Los requerimientos para cada versión los tienes disponibles en la zona de descargas Moodle:
http://download.moodle.org/
Ahí se indican los requerimientos mínimos para cada versión.
Para Moodle 2.2.9 se necesita un mínimo de MySql 5.0.25, así que tu versión 5.0.95 si permitirá la instalación de esta versión.
- Requires: PHP 5.3.2, MySQL 5.0.25 or Postgres 8.3 or MSSQL 2005 or Oracle 10.2