Hola Ricardo,
puedes sustituir esto:
$messagesdata[0]=$DB->count_records_sql("SELECT COUNT('x')".$sql,$params);
por esto
list($sql, $order) = explode("ORDER BY", $sql);
$messagesdata[0]=$DB->count_records_sql("SELECT COUNT('x')".$sql,$params);
En el fichero block_jmail_mailbox.class.php
Y probar a ver si te funciona?