Immagino tu abbia già verificato che i messaggi, ad esempio di un forum, vengano recapitati correttamente nella casella dove non ricevi la notifica della consegna.
Potresti provare a verificare se l'instradamento messaggi sia configurato per inviare l'email: http://docs.moodle.org/22/en/Messaging_settings
Un controllo potresti anche farlo sul mail log del tuo server, in modo da capire se la mail di notifica viene accodata e se ci sono problemi di recapito.