Es que es muy dificil ayudarte sin saber exactamente que estas haciendo.
Si usas BACKUP de Moodle
1 - Ves al moodle que funciona y selecciona 1 curso el que quieras
2 - Vete a administracion del curso y haz copia de seguridad (configura que datos quieres guardar en la copia de seguridad y el nombre y ruta donde guardar el archivo de tu curso)
3 - El archivo generado con el backup llevatelo a donde tengas el otro moodle
4 - Entra en Administracion del sitio y selecciona la opcion de Restaurar cursos y selecciona el archivo resultante del backup paso 2 y 3. Te deberia crear el curso en el moodle nuevo sin problemas, excepto que uses en el moodel antiguo algun componente no estandard que no exista en el moodle nuevo.
Si usas un Backup de sistema
1 - Haz backup de la base de datos, de la carpeta y subcarpetas moodle, de la carpeta y subcarpetas moodledata
2 - en el nuevo servidor, restaura los backups de la base de datos, de la carpeta y subcarpetas moodle y de la carpeta y subcarpetas moodledata
3 - si la ruta del nuevo servidor es exactamente la misma que el antiguo te tiene que funcionar, si cambia por ejemplo de disco c: a disco d: deberas entrar en el config.php de la carpeta moodle editarlo con el bloc de notas y rectificar las rutas de los archivos, bases de datos, etc..