Hola Andreu,
Això de les Qualificacions a la part superior de la pàgina és una característica del moodle instal·lat a odissea (xtec). Vol dir que han dissenyat un tema especial en el qual hi han fet alguna modificació com ara la que esmentes.
Ara bé, si elimines els blocs laterals i vols tenir un enllaç a la part superior o inferiror d ela pàgina el que pots fer és abans de res copiar-te la URL de l'enllaç a les qualificacions. M'explico: abans d'eliminar el bloc vas a administració -> Qualificacions i en lloc de clicar a sobre amb el botó esquerre per entrar-hi, cliques amb el botó dret. T'apareixerà un menú contextual del que hauries de triar Copia la ubicació de l'enllaç (o cosa semblant, depèn del navegador).
Aleshores elimines el bloc i al punt ob vulguis l'enllaç de les Qualificacions poses el text Accés a les Qualificacions, per exemple, i l'enllaces a la URL que téns en memòria (selecciones el text, cliques inserir enllaç i a la URL botó dret del ratolí i Enganxa).
Prova-ho a veure què tal va.