Tengo instalada la versión 1.9 y me ocurrió lo mismo con un cuestionario que contestaron 179 estudiantes solo a 6 no les apareció la calificación automática, pero efectivamente las respuestas están guardadas en la base de datos, teniendo en cuenta tu explicación, realice la calificación manual para cada una de las preguntas que el estudiante contesto bien, de esta manera al ver nuevamente los intentos la calificación real aparece.
Muchas gracias.