Disculpa mi demora en contestar, no habia visto tu post.
Estaba en tu mismo problema y no le encontraba la vuelta. Vi tu post y medio abandoné, pero Moodle todo lo puede... Version 1.9.7
tengo mas de 10000 alumnos registrados y contaba (en pasado lo digo) con más de 600 que nunca habian entrado.
Bien, en avanzadas, "ultimo acceso antes de" poner digamos dos años antes y tildar "Never included" (que esta a la derecha.
Por las dudas, pon la condición "confirmed" en Yes. Casi doy de baja a tres alumnos que se estaban registrando.
Luego, acciones masivas... etc. etc y "borrado".
Anda de diez. Puedes bajarte la lista a un excel en forma previa y hacer algunos cruces, por las dudas. Pero magnifico.
saludos!