A la lecture de la question, je présuppose que vous évoluez en version 2. Il serait utile de le rappeler à chaque nouvelle question. Les utilisateurs compétents n'étant pas forcément les mêmes.
Ceci dit, j'ai quand même du mal à suivre les opérations.
Que voulez-vous faire exactement, afficher un fichier (de quel type ???) pleine page, dans une nouvelle fenêtre, la même fenêtre avec un menu ?
Le réglage cité dans votre message est du coté "administrateur" et se veut être une base de départ, mais chaque enseignant peut dans son espace de cours modifier ces réglages donnés par défaut seulement.
Les modifications sont accessibles dans le formulaire de création / modification de chaque ressource dans la rubrique "Options"
Pour pouvoir paramétrer la taille de la fenêtre accueillant le document, il faut obligatoirement choisir "fenêtre surgissante", les autres disposant déjà de dimensions définies par la taille actuelle du navigateur. Quant on crée un nouvel onglet, il adopte par défaut les dimensions de la fenêtre le contenant, il faut donc passer par la création, mais pas d'une nouvelle fenêtre, car là, nous sommes bloqués par la fonctionnalité des navigateurs récents qui décident arbitrairement (optimisation) que cette commande équivaut à la création d'un nouvel onglet.
Hors sujet, mais pourquoi vouloir afficher un document dans sa globalité sans possibilité de déplacement (ascenseur).
L'affichage de la ressource n'est pas de votre ressort mais dépend complètement du lecteur (l'usager) mais aussi du type de la ressource affichée.
La retranscription PDF d'un texte prévu sur un format imprimé A4 sera dans la plupart des cas (écran classique) illisible si son affichage est global. Il faudra zoomer pour le lire et donc se déplacer dans le document, difficile sans ascenseur.
Une image de définition supérieure à 2Mégapixels sera certes correctement affichée et certainement reconnaissable, mais tous ses points (et donc les détails) ne seront perceptibles qu'après aggrandissement. Inversement afficher une icône plein écran n'a aucun sens ...
Ne pouvant pas gérer tous les cas, types de fichiers, contenus, périphériques de restitution, nous ne pouvons que faire confiance à l'utilisateur final.
Jérôme.