Gracias por la contestación, pero ya lo he solucionado con una cookie, y un par de funciones para crearla y recuperarla.
Ya he conseguido filtrar las categorías y los cursos segun la institucion que se conecta, pero en el bloque de navegación sigue mostrándome todas las categorías y todos los cursos, y necesito también filtrarlos, pero viendo el código del bloque no sé como hacerlo. ¿Alguien sabe?