Hola Luis,
Definitivamente Moodle 2+ ha resultado "polémico" en ciertos aspectos.
Lo que yo pudiera decir es que si uno logra hacer el esfuerzo de adaptarse al nuevo paradigma de navegación, las cosas fluyen bien.
Yo creo que los cambios a la interfase y otros fueron pensados realmente para mejorar y, repito, si uno logra comprender la nueva lógica, se aprecian dichas mejoras.
Tal vez un punto de comparación sea la suite MS-Office, que venía trabajando con una interfase más o menos estable y de pronto la cambiaron radicalmente.
Yo pienso que en este caso los cambios no fueron para ayudar al usuario, sino para conservar el monopolio que ha construido esta compañía en el campo del trabajo de oficina.
Pero independientemente de ello, las personas tuvieron que adaptarse.
Yo siento que no nos queda más que llevar a cabo este proceso.
Personalmente al principio no me agradó mucho el cambio, pero como ya me he metido un poco a ver la lógica de la nueva versión, creo que vale la pena el esfuerzo.
Saludos