Hola
No tengo claro que se puedan incorporar objetos JClic a eXe y que puncionen correctamente y además que todo ello se pueda importar a Moodle 2.x. En cualquier caso, hay que incorporar el plugin JClic para Moodle 2, que parece que ya está disponible (por fin):
https://moodle.org/plugins/view.php?plugin=mod_jclic
Un saludo