Hola Sol,
Me olvidaba: también puedes usar el comando "target" (quizá esto sea lo más fácil), pero con esto se rompe el modelo "XHTML Strict" que sigue Moodle para construir las páginas Web.
Ahora bien, revisando rápidamente, en Moodle 2, con privilegios de un usuario que pueda poner código JavaScript en el editor HTML, puedes colocar lo incluido en el archivo adjunto.
Con algo así puedes abri un pop-up usando el JavaScript del propio Moodle.
Saludos