Из штатный средств для переноса - кнопки резервное копирование и восстановить - учитесь пользоваться ими. А вот ситуацию насчёт того, что сервер упал Вам придётся решать самостоятельно, но если невосстановимо полетела база данных, то дело труба. 95% информации в Moodle хранится в базе данных, а файлы - это только 5%, тем более, что они у преподавателей их загружавших есть и так...