utterramblingsからインストールしたPCREのpcretest -Cの結果です．
PCRE version 8.02 2010-03-19
Compiled with
UTF-8 support
Unicode properties support
Newline sequence is LF
\R matches all Unicode newlines
Internal link size = 2
POSIX malloc threshold = 10
Default match limit = 10000000
Default recursion depth limit = 10000000
Match recursion uses stack
同じバージョンのようですね．とりあえずこれでグローバルサーチは動作するようになったのですが，依然としてバックアップが失敗するコースがありますねぇ．max_execution_timeはコード中でも50分（3000秒）に変更しているようですので，時間切れでは無いと思うのですが，明確なエラーがログに残っていないのでちょっと困っています．