動画キャプチャーにExpression Encoder 3 Screen Captureを使っています。
http://www.microsoft.com/downloads/details.aspx?FamilyID=b6c8015b-e5de-46c0-98cd-1be12eef89a8&displaylang=ja
WMEの後継で無償版もあります。この手のソフトはいろいろ使いましたが、このレベルのソフトが無償だというのはすごい・・・
エンコードはWMVですが有償版だと他のフォーマットにも対応しています。
レビューを書いたことがあるのでもしよろしければ参考にしてみてください。
http://d.hatena.ne.jp/river34/20100422