¿Usas sesiones con base de datos? (la configuración por defecto no las usa). Porque si no es así, puedes vaciar completamente la tabla mdl_sessions sin problemas. Si la usas, con vaciar aquellos registros anteriores a la duración de la sesión de Moodle (valor configurable que suele ser de unas pocas horas o algunos días) listo.
En cuanto a la tabla mdl_cache_text algo similar. Se supone que lo que hay ahí no debería durar más de unos pocos minutos en la tabla y luego debería eliminarse (se cachean textos procesados por los filtros y cosas así), con lo cual incluso si borras el contenido completo de la tabla no deberías tener ningún efecto secundario.
Por otra parte, la versión 1.6 ya ha dejado de estar soportada, con lo cual seguramente será buena idea migrar a una versión más reciente (creo que la 1.7 dejará de estar soportada también en poco tiempo, por cierto).
Saludos, Iñaki.