А Вы, кстати, на какой версии Moodle? Там правки до определенного времени весьма активно шли.
И еще, Вы пробовали прорабатывать проблему в режиме отладки SCORM-а? Для этого надо сайт перевести в Developer отладку. Тогда при работе со скормом в новое окно будет идти весь лог взаимодействия объектов с LMS - иногда удобно подиагностировать.
Мы сейчас в SCORM-е делаем практически работы. Правда чисто на флэше. У нас все нормально сохраняется, отображается и т.п.