Как Вы сами видите - mysqld грузит систему немилосердно. Там постоянно такое значение WCPU?
Подозреваю, что mysqld кто-то "оптимизировал", либо там еще нечто кроме moodle работает.
1. Попробуйте восстановить /etc/mysql/my.cnf как было по умолчанию.
2. Переустановите mysqld.
3. Выдает ли полное имя хоста с именем домена команда hostname -f ?
4. Убедитесь, верно ли настроен /etc/nsswitch.conf, /etc/hosts и /etc/resolv.conf