Нет, в случае с moodle.org проблема была в другом. Даже если убраны все разрывы строки он всё-равно убирает само слово data при сохранении, то есть вместо src="data:image/gif... сохраняется img src="image/gif...
Мне кажется лишний раз с фильтрами заморачиваться не следует, так как фильтр может и отключиться.
Там, где достаточно средств числого html лучше использовать их. Пусть лучше конвертеры и всё прочее готовят материал сразу в хорошем html виде - без разрывов вообще там, где не надо, и с "br" и "p" там, где надо