http://moodle.org/doc/?file=upgrade.html
qui e' spiegato molto bene come fare
Salva tutti i dati, cancella i vecchi (spostali in una dir di backup), metti i nuovi, rimetti tutte le cose che avevi in piu (per esempio theme, blocchi, moduli...)
copia o modifica il file config.php.
vai su http://tuosito/moodle/admin e automaticamente farà l'aggiornamento di tutto.
ciao! per maggiori informazioni puoi scrivermi al mio indirizzo mail