Hola David.
Te cuento que ya solucione.
El problema es que habia creado, en el archivo de configuracion del apache un alias de un directorio files\ de tal manera que no iba a buscar al moodle\files\index,php sino al files\ y como bajo este archivo no hay nada por eso no encontraba la pagina.
lo que hice fue comentar esa linea en el script del archivo de configuracion del apache ya que no lo utilizaba y se soluciono el problema.
Gracias por tu apoyo.
Problemas Generales
Subir archivos al servidor moodle
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