私の登録方法の方がイレギュラーなのかな？
私は登録キーを使ったことがありません．
各コース内の管理メニューで，”ロールの割り当て”により受講学生をStudentロールに割り当てています．ユーザ名を学籍番号としているので，学籍番号の頭（学科と入学年度）でフィルタを掛けて一覧表示し，該当する学生をザッパリと登録しています．過年度生だけは別に登録します．
ファイルによるユーザ登録の際にコースを指定する方法もあると思うのですが，この機能を使って既にユーザ登録済みの学生の登録コースだけを変更することが可能かどうかは分かりません．でも，多分それならば上記方法の方が楽そうですよね．